আগরতলা মামলার প্রকৃত কারণ হলো-

পশ্চিম পাকিস্তানের স্বাধীনতা অক্ষুন্ন রাখা

বাঙালি নেতাদের শাস্তি দেয়া

বাঙালিদের অধিকার আদায়ে বাধা দেয়া

ছয়দফা ভিত্তিক জাতীয়তাবাদী আন্দোলন নস্যাৎ করা